Juan nació en Damasco hacia el año 675 de familia cristiana, cuando ya el territorio de Siria había sido conquistado por los musulmanes. Su padre Sergio ocupaba un lugar importante dentro de la administración. Era el «logotheta», o sea, el responsable de la vida pública de la población cristiana, encargado del cobro de los impuestos y de la conservación de los derechos civiles de quienes, estando sujetos al poder islamita, profesaban la fe de Cristo.
